La participation au Festival olympique de la jeunesse européenne est ouverte à tous les jeunes athlètes européens désignés par leur Comité national olympique membre des COE, en accord avec la Charte du FOJE en vigueur et les règlements des COE concernant les catégories d'âge et les quotas pour chaque édition du FOJE.
Les critères de qualification des athlètes / équipes sont du domaine de compétence des CNO / Fédérations nationales respectifs, à l'exception du hockey sur glace, du curling, du basket-ball, du handball et du volley-ball, qui relèvent des FI/FE respectives.